La Agencia Centroamericana de Navegación Aérea fue creada cuando Los Estados Centroamericanos delegaron a COCESNA la provisión de los servicios a la navegación aérea internacional, en el espacio aéreo de la Región de Información de Vuelo (FIR) Centroamérica. Los límites de esta FIR han sido previamente establecidos mediante acuerdos regionales en materia aeronáutica.
ACNA tiene oficinas técnicas en Belize, Costa Rica, El Salvador, Guatemala, Honduras y Nicaragua, con la responsabilidad de proporcionar los servicios AIM, ATM, CNS e Inspección en vuelo su sede principal y el Centro de Control de Área para vigilancia radar (CENAMER ACC) se encuentra ubicado en la ciudad de Tegucigalpa, Honduras.